在Linux中,可以同时安装同一版本的R和多个不同版本的R。以下是在Linux中安装Seurat2和Seurat3的完整攻略:
确认已经安装了R
在Linux中,可以使用命令行检查是否已经安装了R:
$ R --version
如果已经安装了R,则显示R的版本信息。如果没有安装,则需要先安装R。
安装多个R版本
在Linux中,可以同时安装多个版本的R。使用以下命令安装不同版本的R:
安装R 3.5.1
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.5.1-1bionic
安装R 3.6.0
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.6.0-2bionic
安装完成后,可以使用以下命令检查是否安装成功:
$ R --version
可以看到已经安装了R 3.5.1和R 3.6.0。
安装Seurat包
在安装Seurat包之前,需要先打开R。在命令行中输入R并回车即可打开R。
安装Seurat2包
在R中安装Seurat2包,使用以下命令:
install.packages("Seurat", version = "2.3.4")
安装Seurat3包
在R中安装Seurat3包,使用以下命令:
install.packages("Seurat", version = "3.1.1")
安装完成后,可以使用以下命令检查是否安装成功:
library(Seurat)
成功安装Seurat包后,就可以开始使用它了。
示例
以下是在R 3.5.1中安装Seurat2和在R 3.6.0中安装Seurat3的示例:
R 3.5.1中安装Seurat2
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.5.1-1bionic
$ R
在R中输入以下命令:
install.packages("Seurat", version = "2.3.4")
然后就可以使用Seurat2了。
R 3.6.0中安装Seurat3
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.6.0-2bionic
$ R
在R中输入以下命令:
install.packages("Seurat", version = "3.1.1")
然后就可以使用Seurat3了。
以上就是在Linux中使用同一版本的R同时安装Seurat2和Seurat3的攻略。