下面是关于Caffe数据可视化环境python接口配置教程的详细攻略。在本篇攻略中,我们将会涉及到以下几个主要的部分:
- 确保安装了必要的软件和库
- 下载Caffe源码文件
- 编译配置Caffe
- 安装pycaffe
- 设置PYTHONPATH环境变量
- 示例说明
下面我们对每个部分进行详细阐述。
1. 确保安装了必要的软件和库
在开始配置之前,我们需要确保我们已经安装了以下软件和库:
- python 2.7.x
- numpy
- matplotlib
- boost
- glog
- gflags
- protobuf
可以通过以下命令在Ubuntu上进行安装:
sudo apt-get install python-numpy python-matplotlib \
libboost-all-dev libgflags-dev libprotobuf-dev protobuf-compiler libglog-dev
2. 下载Caffe源码文件
在开始配置Caffe之前,我们需要下载它的源码文件。可以通过以下命令进行克隆:
git clone https://github.com/BVLC/caffe.git
3. 编译配置Caffe
进入caffe目录,执行make命令进行编译。具体命令如下:
cd caffe
cp Makefile.config.example Makefile.config
make all
make test
make runtest
make pycaffe
其中,Makefile.config.example
是Makefile的配置文件,我们需要根据自己的情况进行配置。例如,如果我们要使用CPU进行训练,可以将USE_CUDNN := 1
改成USE_CUDNN := 0
。
4. 安装pycaffe
执行make pycaffe
编译后,我们就可以在./python/caffe
目录下找到pycaffe.py
文件。将该文件拷贝到Python的site-packages目录中,即可使用pycaffe。
cp ./python/caffe/pycaffe.py /usr/lib/python2.7/dist-packages/
5. 设置PYTHONPATH环境变量
为了方便使用pycaffe,我们需要设置PYTHONPATH环境变量。执行如下命令:
export PYTHONPATH=/path/to/caffe/python:$PYTHONPATH
其中,/path/to/caffe
是Caffe的根目录所在的路径。
6. 示例说明
下面我们通过两个示例来说明如何使用caffe/python接口进行数据可视化。
示例1:MNIST数据集可视化
在Caffe中已经提供了MNIST数据集的示例,我们可以使用该示例来进行可视化。
首先,我们需要下载MNIST数据集。可以通过以下命令进行下载:
./data/mnist/get_mnist.sh
之后,我们可以执行以下脚本来将MNIST数据集转化为NumPy数组:
from caffe.proto import caffe_pb2
import lmdb
import numpy as np
import sys
db_name = sys.argv[1]
lmdb_env = lmdb.open(db_name)
lmdb_txn = lmdb_env.begin()
lmdb_cursor = lmdb_txn.cursor()
datum = caffe_pb2.Datum()
data = []
labels = []
for key, value in lmdb_cursor:
datum.ParseFromString(value)
label = datum.label
image = np.array(datum.float_data)
image = image.reshape(datum.channels, datum.height, datum.width)
data.append(image)
labels.append(label)
X = np.array(data)
y = np.array(labels)
最后,我们可以使用matplotlib来可视化MNIST数据集中的一个样本图像:
import matplotlib.pyplot as plt
plt.imshow(X[0][0], cmap=plt.get_cmap('gray'))
plt.show()
示例2:CIFAR-10数据集可视化
同样,我们也可以使用CIFAR-10数据集来进行可视化。CIFAR-10数据集可以通过以下命令进行下载:
./data/cifar10/get_cifar10.sh
与MNIST数据集类似,我们可以编写一个脚本来将CIFAR-10数据集转化为NumPy数组:
import caffe
import numpy as np
TRAIN_MEAN_FILE = 'data/cifar10/mean.binaryproto'
TRAIN_LMDB = 'data/cifar10/train_lmdb'
TEST_LMDB = 'data/cifar10/test_lmdb'
def load_lmdb(db_name):
lmdb_env = lmdb.open(db_name)
lmdb_txn = lmdb_env.begin()
lmdb_cursor = lmdb_txn.cursor()
datum = caffe.proto.caffe_pb2.Datum()
data = []
labels = []
for key, value in lmdb_cursor:
datum.ParseFromString(value)
label = datum.label
image = np.array(caffe.io.datum_to_array(datum)).astype(np.uint8)
data.append(image)
labels.append(label)
return np.array(data), np.array(labels)
def load_mean():
mean_blob = caffe.proto.caffe_pb2.BlobProto()
with open(TRAIN_MEAN_FILE, 'rb') as f:
mean_blob.ParseFromString(f.read())
mean_data = np.asarray(mean_blob.data, dtype=np.float32).reshape(mean_blob.channels, mean_blob.height, mean_blob.width)
return np.transpose(mean_data, (1, 2, 0))
X_train, y_train = load_lmdb(TRAIN_LMDB)
X_test, y_test = load_lmdb(TEST_LMDB)
mean_image = load_mean()
X_train = X_train.astype(np.float32)
X_test = X_test.astype(np.float32)
mean_image = mean_image.astype(np.float32)
X_train -= mean_image
X_test -= mean_image
X_train = X_train.transpose((0, 3, 1, 2))
X_test = X_test.transpose((0, 3, 1, 2))
之后,我们可以使用pyplot.imshow()
函数来可视化CIFAR-10数据集中的一个样本图像:
import matplotlib.pyplot as plt
plt.imshow(np.transpose(X_train[0], (1, 2, 0)), interpolation='nearest')
plt.show()
通过以上示例,我们可以看到如何使用Caffe的Python接口来进行数据可视化。如有不清楚的地方,可以参考Caffe官方文档或者其他教程进行学习。