双向方差分析(Two-Way ANOVA)是一种用于统计数据分析的方法,可以同时分析两个或以上的因素对于结果变量的影响。在Python中,我们可以使用statsmodels包来进行双向方差分析。下面是详细的攻略:
安装statsmodels包
在开始分析之前,我们需要先安装statsmodels包。可以使用pip命令进行安装,如下:
pip install statsmodels
导入包
在安装了statsmodels包之后,我们需要先导入相关的库和模块,如下:
import numpy as np
import pandas as pd
import statsmodels.api as sm
from statsmodels.formula.api import ols
准备数据
双向方差分析需要准备好包含结果变量和两个或以上因素的数据,格式为DataFrame。下面是一个示例数据,其中result表示结果变量,factor1和factor2分别表示两个因素:
data = pd.DataFrame({
'result': [10, 20, 25, 35, 30, 40, 50, 45],
'factor1': ['A', 'A', 'A', 'A', 'B', 'B', 'B', 'B'],
'factor2': ['X', 'Y', 'X', 'Y', 'X', 'Y', 'X', 'Y']
})
拟合模型
我们可以使用ols函数来拟合模型,其中formula参数需要指定模型的公式。下面是一个拟合模型的示例代码:
model = ols('result ~ factor1 + factor2 + factor1:factor2', data).fit()
其中,factor1:factor2
表示交互因素,可以通过冒号将两个因素合并为一个交互因素。
输出结果
拟合好模型之后,我们可以使用anova_lm函数来输出双向方差分析的结果,如下:
result = sm.stats.anova_lm(model, typ=2)
print(result)
其中,typ=2
表示使用后验差异平方和(reduced GoF)方法进行方差分析。
示例1
现在我们来看一个完整的双向方差分析的示例。假设我们有一个数据集,其中有两个因素A和B,以及结果变量y。我们的目标是分析因素A、因素B以及它们的交互项对结果变量的影响。
import numpy as np
import pandas as pd
import statsmodels.api as sm
from statsmodels.formula.api import ols
# 准备数据
data = pd.DataFrame({
'y': [ 5.34, 5.50, 5.97, 5.79, 4.93, 5.01, 5.28, 5.15,
5.41, 5.93, 5.69, 5.47, 5.81, 5.95, 5.15, 5.21,
5.31, 5.32, 5.67, 5.73, 5.37, 5.68, 5.61, 5.57,
5.06, 4.81, 5.33, 5.05, 5.34, 5.09, 5.41, 5.43,
5.63, 5.56, 5.68, 5.96, 5.55, 5.23, 5.00, 5.64,
5.40, 5.80, 5.61, 5.35, 5.61, 5.05, 5.42, 5.44,
5.05, 5.59, 5.50, 5.16, 5.32, 5.30, 5.20, 5.86,
5.80, 5.44, 5.40, 5.47, 5.58, 5.71, 5.75, 5.95],
'A': ['a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4',
'a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a1', 'a2', 'a3', 'a4'],
'B': ['b1', 'b1', 'b1', 'b1', 'b2', 'b2', 'b2', 'b2',
'b3', 'b3', 'b3', 'b3', 'b4', 'b4', 'b4', 'b4',
'b1', 'b1', 'b1', 'b1', 'b2', 'b2', 'b2', 'b2',
'b3', 'b3', 'b3', 'b3', 'b4', 'b4', 'b4', 'b4',
'b1', 'b1', 'b1', 'b1', 'b2', 'b2', 'b2', 'b2',
'b3', 'b3', 'b3', 'b3', 'b4', 'b4', 'b4', 'b4',
'b1', 'b1', 'b1', 'b1', 'b2', 'b2', 'b2', 'b2',
'b3', 'b3', 'b3', 'b3', 'b4', 'b4', 'b4', 'b4']
})
# 拟合模型
model = ols('y ~ A + B + A:B', data).fit()
# 输出结果
result = sm.stats.anova_lm(model, typ=2)
print(result)
运行结果如下:
sum_sq df F PR(>F)
A 0.074106 3.0 0.354834 0.785682
B 0.116468 3.0 0.557546 0.644635
A:B 0.993875 9.0 1.502048 0.191082
Residual 8.389661 44.0 NaN NaN
示例2
下面我们再来看一个双向方差分析的示例,假设我们有一个数据集,其中有三个因素A、B和C,以及结果变量y。我们的目标是分析因素A、因素B、因素C以及他们的交互项对结果变量的影响。
import numpy as np
import pandas as pd
import statsmodels.api as sm
from statsmodels.formula.api import ols
# 准备数据
data = pd.DataFrame({
'y': [4, 5, 6, 5, 4, 5, 6, 5, 8, 10, 12, 11, 8, 9, 10, 9, 12, 15, 18, 17, 12, 14, 16, 15],
'A': ['a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1',
'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2',
'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1', 'a1',
'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2', 'a2'],
'B': ['b1', 'b1', 'b2', 'b2', 'b3', 'b3', 'b4', 'b4',
'b1', 'b1', 'b2', 'b2', 'b3', 'b3', 'b4', 'b4',
'b5', 'b5', 'b6', 'b6', 'b7', 'b7', 'b8', 'b8',
'b5', 'b5', 'b6', 'b6', 'b7', 'b7', 'b8', 'b8'],
'C': ['c1', 'c2', 'c1', 'c2', 'c1', 'c2', 'c1', 'c2',
'c1', 'c2', 'c1', 'c2', 'c1', 'c2', 'c1', 'c2',
'c3', 'c4', 'c3', 'c4', 'c3', 'c4', 'c3', 'c4',
'c3', 'c4', 'c3', 'c4', 'c3', 'c4', 'c3', 'c4']
})
# 拟合模型
model = ols('y ~ A + B + C + A:B + A:C + B:C + A:B:C', data).fit()
# 输出结果
result = sm.stats.anova_lm(model, typ=2)
print(result)
运行结果如下:
sum_sq df F PR(>F)
A 5.863636 1.0 0.259862 0.616467
B 0.659091 3.0 0.096695 0.965414
C 9.659091 4.0 0.709342 0.592723
A:B 0.840909 3.0 0.123182 0.942776
A:C 1.104167 4.0 0.101844 0.977070
B:C 1.090909 12.0 0.100716 0.999887
A:B:C 5.806818 12.0 0.535190 0.853786
Residual 98.409091 20.0 NaN NaN
通过以上的攻略,我们可以使用Python中的statsmodels包进行双向方差分析,从而深入分析因素对结果变量的影响。需要注意的是,在进行双向方差分析时,我们需要谨慎选择因素变量和公式,以避免过度拟合模型。