在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3的教程

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在Linux中,可以同时安装同一版本的R和多个不同版本的R。以下是在Linux中安装Seurat2和Seurat3的完整攻略:

确认已经安装了R

在Linux中,可以使用命令行检查是否已经安装了R:

$ R --version

如果已经安装了R,则显示R的版本信息。如果没有安装,则需要先安装R。

安装多个R版本

在Linux中,可以同时安装多个版本的R。使用以下命令安装不同版本的R:

安装R 3.5.1

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.5.1-1bionic

安装R 3.6.0

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.6.0-2bionic

安装完成后,可以使用以下命令检查是否安装成功:

$ R --version

可以看到已经安装了R 3.5.1和R 3.6.0。

安装Seurat包

在安装Seurat包之前,需要先打开R。在命令行中输入R并回车即可打开R。

安装Seurat2包

在R中安装Seurat2包,使用以下命令:

install.packages("Seurat", version = "2.3.4")

安装Seurat3包

在R中安装Seurat3包,使用以下命令:

install.packages("Seurat", version = "3.1.1")

安装完成后,可以使用以下命令检查是否安装成功:

library(Seurat)

成功安装Seurat包后,就可以开始使用它了。

示例

以下是在R 3.5.1中安装Seurat2和在R 3.6.0中安装Seurat3的示例:

R 3.5.1中安装Seurat2

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.5.1-1bionic
$ R

在R中输入以下命令:

install.packages("Seurat", version = "2.3.4")

然后就可以使用Seurat2了。

R 3.6.0中安装Seurat3

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base=3.6.0-2bionic
$ R

在R中输入以下命令:

install.packages("Seurat", version = "3.1.1")

然后就可以使用Seurat3了。

以上就是在Linux中使用同一版本的R同时安装Seurat2和Seurat3的攻略。